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- mindspore.dataset.GraphData
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- .. py:class:: mindspore.dataset.GraphData(dataset_file, num_parallel_workers=None, working_mode='local', hostname='127.0.0.1', port=50051, num_client=1, auto_shutdown=True)
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- 从共享文件或数据库中读取用于GNN训练的图数据集。
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- **参数:**
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- - **dataset_file** (str) - 数据集文件路径。
- - **num_parallel_workers** (int, 可选) - 读取数据的工作线程数,默认值:None,使用mindspore.dataset.config中配置的线程数。
- - **working_mode** (str, 可选) - 设置工作模式,目前支持'local'/'client'/'server',默认值:'local'。
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- - **local**:用于非分布式训练场景。
- - **client**:用于分布式训练场景。客户端不加载数据,而是从服务器获取数据。
- - **server**:用于分布式训练场景。服务器加载数据并可供客户端使用。
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- - **hostname** (str, 可选) - 图数据集服务器的主机名。该参数仅在工作模式设置为 'client' 或 'server' 时有效,默认值:'127.0.0.1'。
- - **port** (int, 可选) - 图数据服务器的端口,取值范围为1024-65535。此参数仅当工作模式设置为 'client' 或 'server' 时有效,默认值:50051。
- - **num_client** (int, 可选) - 期望连接到服务器的最大客户端数。服务器将根据该参数分配资源。该参数仅在工作模式设置为 'server' 时有效,默认值:1。
- - **auto_shutdown** (bool, 可选) - 当工作模式设置为 'server' 时有效。当连接的客户端数量达到 `num_client` ,且没有客户端正在连接时,服务器将自动退出,默认值:True。
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- **异常:**
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- - **ValueError** - `dataset_file` 路径下数据文件不存在或无效。
- - **ValueError** - `num_parallel_workers` 参数超过系统最大线程数。
- - **ValueError** - `working_mode` 参数取值不为'local', 'client' 或 'server'。
- - **TypeError** - `hostname` 参数类型错误。
- - **ValueError** - `port` 参数不在范围[1024, 65535]内。
- - **ValueError** - `num_client` 参数不在范围[1, 255]内。
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- .. py:method:: get_all_edges(edge_type)
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- 获取图的所有边。
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- **参数:**
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- - **edge_type** (int) - 指定边的类型,在数据集转换为MindRecord格式时,需要指定 `edge_type` 的值,并在此API中对应使用。详见 `加载图数据集 <https://www.mindspore.cn/docs/programming_guide/zh-CN/master/load_dataset_gnn.html>`_ 。
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- **返回:**
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- numpy.ndarray,包含边的数组。
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- **异常:**
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- **TypeError**:参数 `edge_type` 的类型不为整型。
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- .. py:method:: get_all_neighbors(node_list, neighbor_type, output_format=OutputFormat.NORMAL)
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- 获取 `node_list` 所有节点的相邻节点,以 `neighbor_type` 类型返回。格式的定义参见以下示例:1表示两个节点之间连接,0表示不连接。
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- .. list-table:: 邻接矩阵
- :widths: 20 20 20 20 20
- :header-rows: 1
-
- * -
- - 0
- - 1
- - 2
- - 3
- * - 0
- - 0
- - 1
- - 0
- - 0
- * - 1
- - 0
- - 0
- - 1
- - 0
- * - 2
- - 1
- - 0
- - 0
- - 1
- * - 3
- - 1
- - 0
- - 0
- - 0
-
- .. list-table:: 普通格式
- :widths: 20 20 20 20 20
- :header-rows: 1
-
- * - src
- - 0
- - 1
- - 2
- - 3
- * - dst_0
- - 1
- - 2
- - 0
- - 1
- * - dst_1
- - -1
- - -1
- - 3
- - -1
-
- .. list-table:: COO格式
- :widths: 20 20 20 20 20 20
- :header-rows: 1
-
- * - src
- - 0
- - 1
- - 2
- - 2
- - 3
- * - dst
- - 1
- - 2
- - 0
- - 3
- - 1
-
- .. list-table:: CSR格式
- :widths: 40 20 20 20 20 20
- :header-rows: 1
-
- * - offsetTable
- - 0
- - 1
- - 2
- - 4
- -
- * - dstTable
- - 1
- - 2
- - 0
- - 3
- - 1
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- **参数:**
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- - **node_list** (Union[list, numpy.ndarray]) - 给定的节点列表。
- - **neighbor_type** (int) - 指定相邻节点的类型。
- - **output_format** (OutputFormat, 可选) - 输出存储格式,默认值:mindspore.dataset.OutputFormat.NORMAL,取值范围:[OutputFormat.NORMAL, OutputFormat.COO, OutputFormat.CSR]。
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- **返回:**
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- 对于普通格式或COO格式,将返回numpy.ndarray类型的数组表示相邻节点。如果指定了CSR格式,将返回两个numpy.ndarray数组,第一个表示偏移表,第二个表示相邻节点。
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- **异常:**
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- - **TypeError** - 参数 `node_list` 的类型不为列表或numpy.ndarray。
- - **TypeError** - 参数 `neighbor_type` 的类型不为整型。
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- .. py:method:: get_all_nodes(node_type)
-
- 获取图中的所有节点。
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- **参数:**
-
- - **node_type** (int) - 指定节点的类型。在数据集转换为MindRecord格式时,需要指定 `node_type` 的值,并在此API中对应使用。详见 `加载图数据集 <https://www.mindspore.cn/docs/programming_guide/zh-CN/master/load_dataset_gnn.html>`_ 。
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- **返回:**
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- numpy.ndarray,包含节点的数组。
-
- **异常:**
-
- **TypeError**:参数 `node_type` 的类型不为整型。
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- .. py:method:: get_edge_feature(edge_list, feature_types)
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- 获取 `edge_list` 列表中边的特征,以 `feature_types` 类型返回。
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- **参数:**
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- - **edge_list** (Union[list, numpy.ndarray]) - 包含边的列表。
- - **feature_types** (Union[list, numpy.ndarray]) - 包含给定特征类型的列表。
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- **返回:**
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- numpy.ndarray,包含特征的数组。
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- **异常:**
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- - **TypeError** - 参数 `edge_list` 的类型不为列表或numpy.ndarray。
- - **TypeError** - 参数 `feature_types` 的类型不为列表或numpy.ndarray。
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- .. py:method:: get_edges_from_nodes(node_list)
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- 从节点获取边。
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- **参数:**
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- - **node_list** (Union[list[tuple], numpy.ndarray]) - 含一个或多个图节点ID对的列表。
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- **返回:**
-
- numpy.ndarray,含一个或多个边ID的数组。
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- **异常:**
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- **TypeError**:参数 `edge_list` 的类型不为列表或numpy.ndarray。
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- .. py:method:: get_neg_sampled_neighbors(node_list, neg_neighbor_num, neg_neighbor_type)
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- 获取 `node_list` 列表中节所有点的负样本相邻节点,以 `neg_neighbor_type` 类型返回。
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- **参数:**
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- - **node_list** (Union[list, numpy.ndarray]) - 包含节点的列表。
- - **neg_neighbor_num** (int) - 采样的相邻节点数量。
- - **neg_neighbor_type** (int) - 指定负样本相邻节点的类型。
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- **返回:**
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- numpy.ndarray,包含相邻节点的数组。
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- **异常:**
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- - **TypeError** - 参数 `node_list` 的类型不为列表或numpy.ndarray。
- - **TypeError** - 参数 `neg_neighbor_num` 的类型不为整型。
- - **TypeError** - 参数 `neg_neighbor_type` 的类型不为整型。
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- .. py:method:: get_node_feature(node_list, feature_types)
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- 获取 `node_list` 中节点的特征,以 `feature_types` 类型返回。
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- **参数:**
-
- - **node_list** (Union[list, numpy.ndarray]) - 包含节点的列表。
- - **feature_types** (Union[list, numpy.ndarray]) - 指定特征的类型。
-
- **返回:**
-
- numpy.ndarray,包含特征的数组。
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- **异常:**
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- - **TypeError** - 参数 `node_list` 的类型不为列表或numpy.ndarray。
- - **TypeError** - 参数 `feature_types` 的类型不为列表或numpy.ndarray。
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- .. py:method:: get_nodes_from_edges(edge_list)
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- 从图中的边获取节点。
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- **参数:**
-
- - **edge_list** (Union[list, numpy.ndarray]) - 包含边的列表。
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- **返回:**
-
- numpy.ndarray,包含节点的数组。
-
- **异常:**
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- **TypeError** 参数 `edge_list` 不为列表或ndarray。
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- .. py:method:: get_sampled_neighbors(node_list, neighbor_nums, neighbor_types, strategy=SamplingStrategy.RANDOM)
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- 获取已采样相邻节点信息。此API支持多跳相邻节点采样。即将上一次采样结果作为下一跳采样的输入,最多允许6跳。采样结果平铺成列表,格式为[input node, 1-hop sampling result, 2-hop samling result ...]
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- **参数:**
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- - **node_list** (Union[list, numpy.ndarray]) - 包含节点的列表。
- - **neighbor_nums** (Union[list, numpy.ndarray]) - 每跳采样的相邻节点数。
- - **neighbor_types** (Union[list, numpy.ndarray]) - 每跳采样的相邻节点类型。
- - **strategy** (SamplingStrategy, 可选) - 采样策略,默认值:mindspore.dataset.SamplingStrategy.RANDOM。取值范围:[SamplingStrategy.RANDOM, SamplingStrategy.EDGE_WEIGHT]。
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- - **SamplingStrategy.RANDOM**:随机抽样,带放回采样。
- - **SamplingStrategy.EDGE_WEIGHT**:以边缘权重为概率进行采样。
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- **返回:**
-
- numpy.ndarray,包含相邻节点的数组。
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- **异常:**
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- - **TypeError** - 参数 `node_list` 的类型不为列表或numpy.ndarray。
- - **TypeError** - 参数 `neighbor_nums` 的类型不为列表或numpy.ndarray。
- - **TypeError** - 参数 `neighbor_types` 的类型不为列表或numpy.ndarray。
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- .. py:method:: graph_info()
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- 获取图的元信息,包括节点数、节点类型、节点特征信息、边数、边类型、边特征信息。
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- **返回:**
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- dict,图的元信息。键为 `node_num` 、 `node_type` 、 `node_feature_type` 、 `edge_num` 、 `edge_type` 和 `edge_feature_type` 。
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- .. py:method:: random_walk(target_nodes, meta_path, step_home_param=1.0, step_away_param=1.0, default_node=-1)
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- 在节点中的随机游走。
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- **参数:**
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- - **target_nodes** (list[int]) - 随机游走中的起始节点列表。
- - **meta_path** (list[int]) - 每个步长的节点类型。
- - **step_home_param** (float, 可选) - 返回 `node2vec算法 <https://www.kdd.org/kdd2016/papers/files/rfp0218-groverA.pdf>`_ 中的超参,默认值:1.0。
- - **step_away_param** (float, 可选) - `node2vec算法 <https://www.kdd.org/kdd2016/papers/files/rfp0218-groverA.pdf>`_ 中的in和out超参,默认值:1.0。
- - **default_node** (int, 可选) - 如果找不到更多相邻节点,则为默认节点,默认值:-1,表示不给定节点。
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- **返回:**
-
- numpy.ndarray,包含节点的数组。
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- **异常:**
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- - **TypeError** - 参数 `target_nodes` 的类型不为列表或numpy.ndarray。
- - **TypeError** - 参数 `meta_path` 的类型不为列表或numpy.ndarray。
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