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123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748495051525354555657585960616263646566676869707172737475767778798081828384858687888990919293949596979899100101102103104105106107108109110111112113114115116117118119120121122123124125126127128129130131132133134135136137138139140141142143144145146147148149150151152153154155156157158159160161162163164165166167168169170171172173174175176177178179180181182183184185186187188189190191192193194195196197198199200201202203204205206207208209210211212213214215216217218219220221222223224225226227228229230231232233234235236237238239240241242243244245246247248249250251252253254255256257258259260261262263264265266267268269270271272273274275276277278279280281282283284285286287288289290291292293294295296297298299300301302303304305306307308309310311312313314315316317318319320321322323324325326327328329330331332333334335336337338339340341342343344345346347348349350351352353354355356357 |
- mindspore.dataset.GraphData
- ===========================
-
- .. py:class:: mindspore.dataset.GraphData(dataset_file, num_parallel_workers=None, working_mode='local', hostname='127.0.0.1', port=50051, num_client=1, auto_shutdown=True)
-
- 从共享文件和数据库中读取用于GNN训练的图数据集。
-
- **参数:**
-
- - **dataset_file** (str) - 数据集文件路径。
- - **num_parallel_workers** (int, 可选) - 读取数据的工作线程数(默认为None)。
- - **working_mode** (str, 可选) - 设置工作模式,目前支持'local'/'client'/'server'(默认为'local')。
-
- - **local**:用于非分布式训练场景。
- - **client**:用于分布式训练场景。客户端不加载数据,而是从服务器获取数据。
- - **server**:用于分布式训练场景。服务器加载数据并可供客户端使用。
-
- - **hostname** (str, 可选) - 图数据集服务器的主机名。该参数仅在工作模式设置为 'client' 或 'server' 时有效(默认为'127.0.0.1')。
- - **port** (int, 可选) - 图数据服务器的端口,取值范围为1024-65535。此参数仅当工作模式设置为 'client' 或 'server' (默认为50051)时有效。
- - **num_client** (int, 可选) - 期望连接到服务器的最大客户端数。服务器将根据该参数分配资源。该参数仅在工作模式设置为 'server' 时有效(默认为1)。
- - **auto_shutdown** (bool, 可选) - 当工作模式设置为 'server' 时有效。当连接的客户端数量达到 `num_client` ,且没有客户端正在连接时,服务器将自动退出(默认为True)。
-
- **样例:**
-
- >>> graph_dataset_dir = "/path/to/graph_dataset_file"
- >>> graph_dataset = ds.GraphData(dataset_file=graph_dataset_dir, num_parallel_workers=2)
- >>> nodes = graph_dataset.get_all_nodes(node_type=1)
- >>> features = graph_dataset.get_node_feature(node_list=nodes, feature_types=[1])
-
-
- .. py:method:: get_all_edges(edge_type)
-
- 获取图的所有边。
-
- **参数:**
-
- - **edge_type** (int) - 指定边的类型。
-
- **返回:**
-
- numpy.ndarray,包含边的数组。
-
- **样例:**
-
- >>> edges = graph_dataset.get_all_edges(edge_type=0)
-
- **异常:**
-
- **TypeError**:参数 `edge_type` 的类型不为整型。
-
- .. py:method:: get_all_neighbors(node_list, neighbor_type, output_format=<OutputFormat.NORMAL: 0。
-
- 获取 `node_list` 所有节点的邻居,以 `neighbor_type` 类型返回。格式的定义参见以下示例:1表示两个节点之间连接,0表示不连接。
-
- .. list-table:: 邻接矩阵
- :widths: 20 20 20 20 20
- :header-rows: 1
-
- * -
- - 0
- - 1
- - 2
- - 3
- * - 0
- - 0
- - 1
- - 0
- - 0
- * - 1
- - 0
- - 0
- - 1
- - 0
- * - 2
- - 1
- - 0
- - 0
- - 1
- * - 3
- - 1
- - 0
- - 0
- - 0
-
- .. list-table:: 普通格式
- :widths: 20 20 20 20 20
- :header-rows: 1
-
- * - src
- - 0
- - 1
- - 2
- - 3
- * - dst_0
- - 1
- - 2
- - 0
- - 1
- * - dst_1
- - -1
- - -1
- - 3
- - -1
-
- .. list-table:: COO格式
- :widths: 20 20 20 20 20 20
- :header-rows: 1
-
- * - src
- - 0
- - 1
- - 2
- - 2
- - 3
- * - dst
- - 1
- - 2
- - 0
- - 3
- - 1
-
- .. list-table:: CSR格式
- :widths: 40 20 20 20 20 20
- :header-rows: 1
-
- * - offsetTable
- - 0
- - 1
- - 2
- - 4
- -
- * - dstTable
- - 1
- - 2
- - 0
- - 3
- - 1
-
- **参数:**
-
- - **node_list** (Union[list, numpy.ndarray]) - 给定的节点列表。
- - **neighbor_type** (int) - 指定邻居节点的类型。
- - **output_format** (OutputFormat, 可选) - 输出存储格式(默认为mindspore.dataset.engine.OutputFormat.NORMAL)取值范围:[OutputFormat.NORMAL, OutputFormat.COO, OutputFormat.CSR]。
-
- **返回:**
-
- 对于普通格式或COO格式,将返回numpy.ndarray类型的数组表示邻居节点。如果指定了CSR格式,将返回两个numpy.ndarray数组,第一个表示偏移表,第二个表示邻居节点。
-
- **样例:**
-
- >>> from mindspore.dataset.engine import OutputFormat
- >>> nodes = graph_dataset.get_all_nodes(node_type=1)
- >>> neighbors = graph_dataset.get_all_neighbors(node_list=nodes, neighbor_type=2)
- >>> neighbors_coo = graph_dataset.get_all_neighbors(node_list=nodes, neighbor_type=2,
- ... output_format=OutputFormat.COO)
- >>> offset_table, neighbors_csr = graph_dataset.get_all_neighbors(node_list=nodes, neighbor_type=2,
- ... output_format=OutputFormat.CSR)
-
- **异常:**
-
- - **TypeError** - 参数 `node_list` 的类型不为列表或numpy.ndarray。
- - **TypeError** - 参数 `neighbor_type` 的类型不为整型。
-
- .. py:method:: get_all_nodes(node_type)
-
- 获取图中的所有节点。
-
- **参数:**
-
- - **node_type** (int) - 指定节点的类型。
-
- **返回:**
-
- numpy.ndarray,包含节点的数组。
-
- **样例:**
-
- >>> nodes = graph_dataset.get_all_nodes(node_type=1)
-
- **异常:**
-
- **TypeError**:参数 `node_type` 的类型不为整型。
-
- .. py:method:: get_edges_from_nodes(node_list)
-
- 从节点获取边。
-
- **参数:**
-
- - **node_list** (Union[list[tuple], numpy.ndarray]) - 含一个或多个图节点ID对的列表。
-
- **返回:**
-
- numpy.ndarray,含一个或多个边ID的数组。
-
- **示例:**
-
- >>> edges = graph_dataset.get_edges_from_nodes(node_list=[(101, 201), (103, 207)])
-
- **异常:**
-
- **TypeError**:参数 `edge_list` 的类型不为列表或numpy.ndarray。
-
- .. py:method:: get_edge_feature(edge_list, feature_types)
-
- 获取 `edge_list` 列表中边的特征,以 `feature_types` 类型返回。
-
- **参数:**
-
- - **edge_list** (Union[list, numpy.ndarray]) - 包含边的列表。
- - **feature_types** (Union[list, numpy.ndarray]) - 包含给定特征类型的列表。
-
- **返回:**
-
- numpy.ndarray,包含特征的数组。
-
- **样例:**
-
- >>> edges = graph_dataset.get_all_edges(edge_type=0)
- >>> features = graph_dataset.get_edge_feature(edge_list=edges, feature_types=[1])
-
- **异常:**
-
- - **TypeError** - 参数 `edge_list` 的类型不为列表或numpy.ndarray。
- - **TypeError** - 参数 `feature_types` 的类型不为列表或numpy.ndarray。
-
-
- .. py:method:: get_neg_sampled_neighbors(node_list, neg_neighbor_num, neg_neighbor_type)
-
- 获取 `node_list` 列表中节所有点的负样本邻居,以 `neg_neighbor_type` 类型返回。
-
- **参数:**
-
- - **node_list** (Union[list, numpy.ndarray]) - 包含节点的列表。
- - **neg_neighbor_num** (int) - 采样的邻居数量。
- - **neg_neighbor_type** (int) - 指定负样本邻居的类型。
-
- **返回:**
-
- numpy.ndarray,包含邻居的数组。
-
- **样例:**
-
- >>> nodes = graph_dataset.get_all_nodes(node_type=1)
- >>> neg_neighbors = graph_dataset.get_neg_sampled_neighbors(node_list=nodes, neg_neighbor_num=5,
- ... neg_neighbor_type=2)
-
- **异常:**
-
- - **TypeError** - 参数 `node_list` 的类型不为列表或numpy.ndarray。
- - **TypeError** - 参数 `neg_neighbor_num` 的类型不为整型。
- - **TypeError** - 参数 `neg_neighbor_type` 的类型不为整型。
-
- .. py:method:: get_nodes_from_edges(edge_list)
-
- 从图中的边获取节点。
-
- **参数:**
-
- - **edge_list** (Union[list, numpy.ndarray]) - 包含边的列表。
-
- **返回:**
-
- numpy.ndarray,包含节点的数组。
-
- **异常:**
-
- **TypeError:** 参数 `edge_list` 不为列表或ndarray。
-
- .. py:method:: get_node_feature(node_list, feature_types)
-
- 获取 `node_list` 中节点的特征,以 `feature_types` 类型返回。
-
- **参数:**
-
- - **node_list** (Union[list, numpy.ndarray]) - 包含节点的列表。
- - **feature_types** (Union[list, numpy.ndarray]) - 指定特征的类型。
-
- **返回:**
-
- numpy.ndarray,包含特征的数组。
-
- **示例:**
-
- >>> nodes = graph_dataset.get_all_nodes(node_type=1)
- >>> features = graph_dataset.get_node_feature(node_list=nodes, feature_types=[2, 3])
-
- **异常:**
-
- - **TypeError** - 参数 `node_list` 的类型不为列表或numpy.ndarray。
- - **TypeError** - 参数 `feature_types` 的类型不为列表或numpy.ndarray。
-
- .. py:method:: get_sampled_neighbors(node_list, neighbor_nums, neighbor_types, strategy=<SamplingStrategy.RANDOM: 0>)
-
- 获取已采样邻居信息。此API支持多跳邻居采样。即将上一次采样结果作为下一跳采样的输入,最多允许6跳。采样结果平铺成列表,格式为[input node, 1-hop sampling result, 2-hop samling result ...]
-
- **参数:**
-
- - **node_list** (Union[list, numpy.ndarray]) - 包含节点的列表。
- - **neighbor_nums** (Union[list, numpy.ndarray]) - 每跳采样的邻居数。
- - **neighbor_types** (Union[list, numpy.ndarray]) - 每跳采样的邻居类型。
- - **strategy** (SamplingStrategy, 可选) - 采样策略(默认为mindspore.dataset.engine.SamplingStrategy.RANDOM)。取值范围:[SamplingStrategy.RANDOM, SamplingStrategy.EDGE_WEIGHT]。
-
- - **SamplingStrategy.RANDOM**:随机抽样,带放回采样。
- - **SamplingStrategy.EDGE_WEIGHT**:以边缘权重为概率进行采样。
-
- **返回:**
-
- numpy.ndarray,包含邻居的数组。
-
- *样例:**
-
- >>> nodes = graph_dataset.get_all_nodes(node_type=1)
- >>> neighbors = graph_dataset.get_sampled_neighbors(node_list=nodes, neighbor_nums=[2, 2],
- ... neighbor_types=[2, 1])
-
- **异常:**
-
- - **TypeError** - 参数 `node_list` 的类型不为列表或numpy.ndarray。
- - **TypeError** - 参数 `neighbor_nums` 的类型不为列表或numpy.ndarray。
- - **TypeError** - 参数 `neighbor_types` 的类型不为列表或numpy.ndarray。
-
-
- .. py:method:: graph_info()
-
- 获取图的元信息,包括节点数、节点类型、节点特征信息、边数、边类型、边特征信息。
-
- **返回:**
-
- dict,图的元信息。键为 `node_num` 、 `node_type` 、 `node_feature_type` 、 `edge_num` 、 `edge_type` 、和 `edge_feature_type` 。
-
-
- .. py:method:: random_walk(target_nodes, meta_path, step_home_param=1.0, step_away_param=1.0, default_node=-1)
-
- 在节点中的随机游走。
-
- **参数:**
-
- - **target_nodes** (list[int]) - 随机游走中的起始节点列表。
- - **meta_path** (list[int]) - 每个步长的节点类型。
- - **step_home_param** (float, 可选) - 返回node2vec算法中的超参(默认为1.0)。
- - **step_away_param** (float, 可选) - node2vec算法中的in和out超参(默认为1.0)。
- - **default_node** (int, 可选) - 如果找不到更多邻居,则为默认节点(默认值为-1,表示不给定节点)。
-
- **返回:**
-
- numpy.ndarray,包含节点的数组。
-
- **示例:**
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- >>> nodes = graph_dataset.get_all_nodes(node_type=1)
- >>> walks = graph_dataset.random_walk(target_nodes=nodes, meta_path=[2, 1, 2])
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- **异常:**
-
- - **TypeError** - 参数 `target_nodes` 的类型不为列表或numpy.ndarray。
- - **TypeError** - 参数 `meta_path` 的类型不为列表或numpy.ndarray。
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