| @@ -0,0 +1,194 @@ | |||||
| import libsvm.*; | |||||
| import java.io.*; | |||||
| import java.util.*; | |||||
| class svm_predict { | |||||
| private static svm_print_interface svm_print_null = new svm_print_interface() | |||||
| { | |||||
| public void print(String s) {} | |||||
| }; | |||||
| private static svm_print_interface svm_print_stdout = new svm_print_interface() | |||||
| { | |||||
| public void print(String s) | |||||
| { | |||||
| System.out.print(s); | |||||
| } | |||||
| }; | |||||
| private static svm_print_interface svm_print_string = svm_print_stdout; | |||||
| static void info(String s) | |||||
| { | |||||
| svm_print_string.print(s); | |||||
| } | |||||
| private static double atof(String s) | |||||
| { | |||||
| return Double.valueOf(s).doubleValue(); | |||||
| } | |||||
| private static int atoi(String s) | |||||
| { | |||||
| return Integer.parseInt(s); | |||||
| } | |||||
| private static void predict(BufferedReader input, DataOutputStream output, svm_model model, int predict_probability) throws IOException | |||||
| { | |||||
| int correct = 0; | |||||
| int total = 0; | |||||
| double error = 0; | |||||
| double sumv = 0, sumy = 0, sumvv = 0, sumyy = 0, sumvy = 0; | |||||
| int svm_type=svm.svm_get_svm_type(model); | |||||
| int nr_class=svm.svm_get_nr_class(model); | |||||
| double[] prob_estimates=null; | |||||
| if(predict_probability == 1) | |||||
| { | |||||
| if(svm_type == svm_parameter.EPSILON_SVR || | |||||
| svm_type == svm_parameter.NU_SVR) | |||||
| { | |||||
| svm_predict.info("Prob. model for test data: target value = predicted value + z,\nz: Laplace distribution e^(-|z|/sigma)/(2sigma),sigma="+svm.svm_get_svr_probability(model)+"\n"); | |||||
| } | |||||
| else | |||||
| { | |||||
| int[] labels=new int[nr_class]; | |||||
| svm.svm_get_labels(model,labels); | |||||
| prob_estimates = new double[nr_class]; | |||||
| output.writeBytes("labels"); | |||||
| for(int j=0;j<nr_class;j++) | |||||
| output.writeBytes(" "+labels[j]); | |||||
| output.writeBytes("\n"); | |||||
| } | |||||
| } | |||||
| while(true) | |||||
| { | |||||
| String line = input.readLine(); | |||||
| if(line == null) break; | |||||
| StringTokenizer st = new StringTokenizer(line," \t\n\r\f:"); | |||||
| double target = atof(st.nextToken()); | |||||
| int m = st.countTokens()/2; | |||||
| svm_node[] x = new svm_node[m]; | |||||
| for(int j=0;j<m;j++) | |||||
| { | |||||
| x[j] = new svm_node(); | |||||
| x[j].index = atoi(st.nextToken()); | |||||
| x[j].value = atof(st.nextToken()); | |||||
| } | |||||
| double v; | |||||
| if (predict_probability==1 && (svm_type==svm_parameter.C_SVC || svm_type==svm_parameter.NU_SVC)) | |||||
| { | |||||
| v = svm.svm_predict_probability(model,x,prob_estimates); | |||||
| output.writeBytes(v+" "); | |||||
| for(int j=0;j<nr_class;j++) | |||||
| output.writeBytes(prob_estimates[j]+" "); | |||||
| output.writeBytes("\n"); | |||||
| } | |||||
| else | |||||
| { | |||||
| v = svm.svm_predict(model,x); | |||||
| output.writeBytes(v+"\n"); | |||||
| } | |||||
| if(v == target) | |||||
| ++correct; | |||||
| error += (v-target)*(v-target); | |||||
| sumv += v; | |||||
| sumy += target; | |||||
| sumvv += v*v; | |||||
| sumyy += target*target; | |||||
| sumvy += v*target; | |||||
| ++total; | |||||
| } | |||||
| if(svm_type == svm_parameter.EPSILON_SVR || | |||||
| svm_type == svm_parameter.NU_SVR) | |||||
| { | |||||
| svm_predict.info("Mean squared error = "+error/total+" (regression)\n"); | |||||
| svm_predict.info("Squared correlation coefficient = "+ | |||||
| ((total*sumvy-sumv*sumy)*(total*sumvy-sumv*sumy))/ | |||||
| ((total*sumvv-sumv*sumv)*(total*sumyy-sumy*sumy))+ | |||||
| " (regression)\n"); | |||||
| } | |||||
| else | |||||
| svm_predict.info("Accuracy = "+(double)correct/total*100+ | |||||
| "% ("+correct+"/"+total+") (classification)\n"); | |||||
| } | |||||
| private static void exit_with_help() | |||||
| { | |||||
| System.err.print("usage: svm_predict [options] test_file model_file output_file\n" | |||||
| +"options:\n" | |||||
| +"-b probability_estimates: whether to predict probability estimates, 0 or 1 (default 0); one-class SVM not supported yet\n" | |||||
| +"-q : quiet mode (no outputs)\n"); | |||||
| System.exit(1); | |||||
| } | |||||
| public static void main(String argv[]) throws IOException | |||||
| { | |||||
| int i, predict_probability=0; | |||||
| svm_print_string = svm_print_stdout; | |||||
| // parse options | |||||
| for(i=0;i<argv.length;i++) | |||||
| { | |||||
| if(argv[i].charAt(0) != '-') break; | |||||
| ++i; | |||||
| switch(argv[i-1].charAt(1)) | |||||
| { | |||||
| case 'b': | |||||
| predict_probability = atoi(argv[i]); | |||||
| break; | |||||
| case 'q': | |||||
| svm_print_string = svm_print_null; | |||||
| i--; | |||||
| break; | |||||
| default: | |||||
| System.err.print("Unknown option: " + argv[i-1] + "\n"); | |||||
| exit_with_help(); | |||||
| } | |||||
| } | |||||
| if(i>=argv.length-2) | |||||
| exit_with_help(); | |||||
| try | |||||
| { | |||||
| BufferedReader input = new BufferedReader(new FileReader(argv[i])); | |||||
| DataOutputStream output = new DataOutputStream(new BufferedOutputStream(new FileOutputStream(argv[i+2]))); | |||||
| svm_model model = svm.svm_load_model(argv[i+1]); | |||||
| if (model == null) | |||||
| { | |||||
| System.err.print("can't open model file "+argv[i+1]+"\n"); | |||||
| System.exit(1); | |||||
| } | |||||
| if(predict_probability == 1) | |||||
| { | |||||
| if(svm.svm_check_probability_model(model)==0) | |||||
| { | |||||
| System.err.print("Model does not support probabiliy estimates\n"); | |||||
| System.exit(1); | |||||
| } | |||||
| } | |||||
| else | |||||
| { | |||||
| if(svm.svm_check_probability_model(model)!=0) | |||||
| { | |||||
| svm_predict.info("Model supports probability estimates, but disabled in prediction.\n"); | |||||
| } | |||||
| } | |||||
| predict(input,output,model,predict_probability); | |||||
| input.close(); | |||||
| output.close(); | |||||
| } | |||||
| catch(FileNotFoundException e) | |||||
| { | |||||
| exit_with_help(); | |||||
| } | |||||
| catch(ArrayIndexOutOfBoundsException e) | |||||
| { | |||||
| exit_with_help(); | |||||
| } | |||||
| } | |||||
| } | |||||